技术概述
药靶互作位点鉴定通过交联质谱（XL-MS）、LiP-MS 结合分子对接等技术，精确定位小分子药物与靶标蛋白的结合位点，揭示药物作用的分子机制。
技术路线
- 交联质谱 XL-MS：使用化学交联剂捕获蛋白-配体复合物，质谱解析交联肽段确定空间邻近关系
- LiP-MS 构象指纹：通过药物诱导的构象变化肽段指纹图谱定位结合区域
- 分子对接验证：计算模拟预测结合模式，与实验数据交叉验证
- 突变验证：定点突变候选位点，通过功能实验确认关键残基
应用价值
- 指导先导化合物优化：明确 SAR 关键位点
- 揭示选择性机制：解释化合物对同家族蛋白的选择性差异
- 支持专利布局：提供新颖的结构生物学证据